孙传庭致仕后不久，朱由检决意禅位，但是在此之前，他决定办一件大事。
崇祯三十五年初夏某一日，一道特别圣旨从乾清宫发出，一队队锦衣卫从京城各个城门驰出，奔赴大明各地。
这道圣旨针对的就是各地藩王。
圣旨措辞十分严厉，内容是要求各地郡王以上宗室，必须在崇祯三十五年年底前，举家迁往南涯行省以及北美新大陆，违者以謀逆论处，其在大明本土所有财产全部变现，款额由太仓支付。
也就是说，这些藩王郡王们名下的田地、商铺、工坊、宅邸从此之后不再归个人所有，而是成为朝廷公有财产。
其中各地王府将会进行改建后作为当地高等学堂使用，其他不动产对外出租，所得费用用于补贴学堂、医院所耗，其权益归属当地官府。
这次迁移令中明确要求，江北之地藩王宗亲一律移往南涯行省，地处江南者全部迁往北美新大陆。
经过十几年的建设，四海商行对北美大陆的开发已经取得了一定的进展，一些地区的基础设施也已初俱规模，他们选取一条大河上游（密西西比河）附近作为落脚点，后续的开发以此为基点向四周扩散着，拖家带口的藩王宗室们将会成为开发的新动力。
考虑到藩王宗室对这道圣旨的极强抗拒性，锦衣卫奉命派出大批人员分赴各地，他们将会“协助”这些宗室进行迁移，四海商行名下的车马行、船运公司会给与鼎力协作和支持。
藩王这颗毒瘤不能留给后代子孙去头疼，既然自己要退位，那就最后做一次坏人吧。
从今往后，大明封藩将全部移往海外，本土不再赐封土地。
同年秋，缅甸王弟莽白杀其兄莽达后篡位，朱由检闻讯大怒，随即遣官军出云南击之，斩缅甸大兵两千余，俘获莽白并杀之，另立莽达幼子为缅甸王。
由于其年幼无知，故遣云南大儒数名进驻缅甸王宫，教授其正宗儒家文明，因怕其遭受莽白势力反噬，特遣官军三千名留驻缅甸，护其王室及缅甸国家之安危，并收缴缅甸全境武备，遣散军队。
莽白是原先历史中咒水之难的制造者，正是他下令将永历帝的护卫全部杀死，并最终将这位南明最后一位皇帝交给了吴三桂。
本来朱由检早就将其遗忘，但合该这厮命当该绝，居然还如原来历史中一样篡位謀逆，正巧无意中提醒了朱由检并表明了自己的存在，给了大明一个控制缅甸的机会，大明舰队也由此多了几处印度洋出海口。
在做完这几件事情之后，朱由检与崇祯三十五年十一月下达在位期间最后一道明发天下的诏书，言称自己年老多病，日常处置国事大有力不从心之感；太子有仁君之姿，正值壮年，当即位登基替父操劳，故自即日起朕退位休养，天下军民皆应一体领命为盼。
因为早就提前放出风声，不管是朝堂还是民间，早就耳闻皇帝有欲退位让贤之意，所以诏书在京城中并未引起太大的波动，没有人去联想到其他。
在发布诏书后的当天，朱由检与周后、田贵妃、袁妃等人分乘数辆四轮马车，在一百名锦衣缇骑的护卫下悄然离京，开启了游遍大明的旅程。
已经年过六旬的王承恩也一同随行，这次旅程的一应事务由他一手安排。
朱由检一行的首站定在济南府，在领略大明湖的风采后向南直奔泰安，在拜祭这座五岳之尊后前行至东昌府，由此乘船沿大运河去往扬州，然后在烟雨江南度过春天。
等到游玩归来返京，朱由检以及后宫嫔妃们将会入驻整修一新的西苑，从此如无特殊情况，终生不再踏入乾清宫。
得知父母离京远游的消息后，朱慈烺亲自驱马飞奔去寻，朱由检一行却早就杳然无踪，朱慈烺跪地南向大哭后返回东宫。
首辅卢象升邀约内阁重臣以及在京文武百官以及一众勋戚，齐聚东宫，请太子继位，朱慈烺辞让三次，无奈之下只得于乾清宫加冕登基接受百官朝拜，是为大明第十八代帝王。
新皇登基后发布第一道诏书，遥尊朱由检为太上皇，加尊号为“文成武德圣皇帝”，并言明，太上皇之意即为朕之意，天下但有不从者以欺君论处，此前规矩一如既往。
次年，朱慈烺改年号为“承乾”元年。
当年年底，朱由检结束为期一年的游玩返京，当晚，承乾帝夫妇携三个孩子，与永王、定王以及朱媺娖夫妇赴西苑探望父母，一家人言谈甚欢，期间朱慈烺再次提出将皇位还给父亲，但被朱由检含笑拒绝。
承乾八年，首辅卢象升致仕，承乾帝圣旨特赐其太子太傅、华盖殿大学士、特晋紫金光禄大夫、配享太庙。
同年原阁老陈奇瑜病逝，太上皇遣特使悼念，追授谥号“文成”，并准其配享太庙。
承乾十二年，田贵妃病逝。
承乾十四年，归家养老的秦良玉去世，太上皇大恸，特遣阁臣温侃亲往石柱土司吊唁，并追赠谥号“武毅”，准其配享太庙，另赠其家人银币一万枚。
承乾十七年，原首辅孙传庭逝世，年近七旬的太上皇亲往府上拜祭并洒泪当场，追赠谥号“文正”，准其配享太庙，另赠银币一万枚。
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