这在当时NBA球员薪酬榜上高居前三位。以金钱形式，乔丹证明并实现了自己的价值。
就在这一片喜悦中，公牛队在常规赛中再次受挫。公牛队自乔丹加盟以来，首次面临常规赛就被淘汰的危险。但在这时候，皮蓬的出现给公牛队带来了转机。
与克利夫兰队最后一场比赛中，皮蓬得24分，直追乔丹的39分。乔丹皮蓬时代的到来，公牛队结束了常规赛后期的困境。乔丹认为皮蓬是个聪明的球员，对球赛有深入全面的了解，不但在进攻上有出色的表现，而且在防守方面更表现得很有技巧。
乔丹在公牛队的82场常规赛里有81场是队中的得分王，其中有18场比赛乔丹的得分超过了40分，同样令人惊讶的是乔丹未能达到20分的比赛仅有3场。乔丹进入NBA第四个赛季之后，已经毫无疑问地成为NBA最令人激动人心的球员。
88年夏天，乔丹为耐克公司到欧洲作巡回推销，突然发现，他的名字在欧洲已是家喻户晓了。这时的他已不再只是一一个成功的球星，他已经成了美国人的骄傲。提起乔丹，美国人会竖起大拇指“嘿!我们的迈克尔是世界最好的!”
也正是在巡回推销之后，乔丹才意识到了球场外生意决策的重要性。此前一直在努力追赶的魔术师和伯德，贴好球星这个标签，意识到篮球的确是一桩大生意。于是乔丹萌生了学习生意经的欲望。
当然，这一切乔丹的父母也曾教导过他，打好球，还得学会为生活准备资金，父母还给乔丹举了很多生动的例子有不少球员打球挣了很多钱，但当他们的篮球生涯结束后，几年内又变成了一贫如洗。
不过，乔丹最看重的还是打比赛，一直想着等到退役以后再做考虑。跟别的球员作比较，发现不足，及时总结，迎头赶超。总是确保所作所为是为了走在别人前头，这些跟金钱或做生意都没关系。
通过观察，乔丹发现了魔术师和伯德都是很优秀的球员，但他们并不以防守见长。于是乔丹就意识到，防守可以让他变得与众不同，于是下定决心要让自己成为一名能在球场两端都具影响力的全能型球员，让人们知道他有在魔术师和大鸟身上所见不到的运动天赋。
“在防守方面，我和其他球员一样，主要是依靠揣测而行。当我进攻时，我会完全知道下一步要如何走在，防守时，我也能估计对手将会如何行动，不过当然不及进攻时估计得那么准确。这就是比赛的特质。”
对于乔丹的防守能力，国王队的助理教练雷诺兹说:“每次你一见他，总会发现他的一些新的东西。事情就是这样，如果你见到了威尔金斯，你可能会认为，他已经是十分了不起的优秀运动员了。然而，如果你这时又见到乔丹，那么你就会想，或许我的看法不大对.....如果在比赛的整个晚上，都只有一个人来防守乔丹的话，他一定会得60分以上。其他运动员固然不错，但乔丹却已将水平发挥到了更高一级。如果他集中精力只进行防守的话，他一定会是名优秀的防守运动员，足以与NBA任何优秀后卫媲美。”最后他又补了一句:“如果他每场只得十五六分，尽全力防守的话，那他的防守将无任何人可及。”
当年常规赛结束以后，乔丹将得分王和联盟最佳防守队员的奖杯同时揽入怀中。而在联盟历史上，同时获得这两个奖项的，乔丹还是第一人。
在季后赛首轮，公牛队依靠乔丹最后时刻的进攻，把骑士队淘汰出局，通过了第一轮，这是公牛队自乔丹加盟以来来首次进入第二轮。
公牛队半决赛上被活塞队收拾，而且输得很惨，公牛队在五场中只胜了一场，以1比4落败。首场比赛乔丹在杜马斯的严密防守下，乔丹开始16次投篮，只有6次命中，整场只得29分，活塞队以93比82取胜。
第二场，虽然公牛队队员众志成城在客场取得一场胜利，乔丹得36分，文森特得31分，公中队以105比95胜出。
但回到芝加哥后两个主场全失，尤其是在第三场比赛，活塞队中锋兰比尔利用最强硬的身体碰撞来防守乔丹，成功地减少了乔丹得分的机会，最终以4比1的总比分将公牛队淘汰，
乔丹在10场季后赛里平均每场得36.3分，7.1个篮板，4.7次助攻。事实证明，这时的乔丹尽管是联盟里最出色的球员之一，但对于率领球队获胜，他仍然不具备决断力。
在休赛期，公牛队做出了一笔令人震惊的交易，将队中的篮板王奥克利送到尼克斯队，换来了2.16米的中锋卡特莱特，并从菲尼克斯太阳队买来了三分球神射手霍奇斯。
这让乔丹有些不解，要知道，奥克利在联盟中篮板排行榜上一直排在前列，而刚结束的赛季中联盟的篮板王就是在奥克利和快船队的凯吉之间角逐的。
奥克利在4月22日出战克利夫兰骑士队时，抓下队史上第二高的35个篮板球，让他以半个球之差领先凯吉，但是两天后，凯吉在对西雅图超音速队一役中抓下了30个篮板，使得凯吉最后以13.03个篮板超越奥克利的13个，而夺得了篮板王宝座。不过奥克利仍以1066个总篮板球数，连续第二年居NBA之冠。
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