吕蒙出生于光和元年（公元178年）。吕蒙年少时，南渡长江（汝南富陂在今天的安徽阜南吕家岗，位于淮河以北，此处“南渡”也有可能是指南渡淮河），依附姐夫邓当。
邓当为孙策的部将，曾数次征伐山越。吕蒙大约十五六岁，曾偷偷跟随姐夫邓当外出作战。后来，邓当发现了他，非常吃惊，并厉声喝叱他，但吕蒙依旧偷偷跟随。作战归来，邓当将此事告诉吕母。吕母很生气并要处罚他，吕蒙说道：“娘亲，现在这样贫贱的日子，实在是难以生活下去。外出作战，说不定可以获得功劳，就能取得富贵。况且，不入虎穴，焉得虎子？
当时，邓当的一个手下官员，见吕蒙年幼，很轻视他，说道：“吕蒙那小子有什么能耐？这是想拿肉喂虎而已。”后来，又当面耻笑羞辱吕蒙。吕蒙大怒，举刀而杀之，逃到同乡郑长家中。后通过校尉袁雄出来自首，袁雄为吕蒙从中说情，并将他推荐给孙策。孙策见吕蒙确有过人之处，便把他安排在身边作事。几年后，邓当去世。张昭推荐吕蒙接替邓当职务，任别部司马。
建安五年（公元200年），孙策遇刺身亡，享年26岁。孙权接掌了江东的大权，想把那些统兵较少又发挥不了多少作用的年轻将领检选出来，把他们的部下加以调整合并。吕蒙听说后，知道部队合并后，自己想有所作为，就更困难了。于是，他想办法赊来物品，为部下赶制了绛色的服装和绑腿，并加紧操练。孙权检阅时，吕蒙兵马“陈列赫然，兵人练习”，孙权见后大悦，认为他治军有方。不但没有削减其部，反而增加了他的兵员。
建安九年（公元204年），孙权讨伐黄祖，击破黄祖水军，获悉丹阳、豫章、庐陵三郡的山越起事。孙权引军返回，吕蒙随军征讨。至豫章郡，孙权命征虏将军吕范平鄱阳，荡寇将军程普进击乐安，建昌都尉太史慈抚治海昏，同时，令吕蒙与别部司马黄盖、韩当、周泰等率兵镇守险要，担任山越最为活跃地区的县令或县长。吕蒙与诸将遵照孙权的部署，各自以武力平定了本地区起事的山越族人。吕蒙因功被任命为平北都尉，兼任广德长。
建安十三年（208年），孙权采纳将军甘宁建议，发兵进攻夏口，吕蒙随军出征。江夏郡太守黄祖下令用蒙冲战舰封锁沔口，用大棕绳系巨石为锥以固定舰位，上有千余人用弓弩交射，封锁江面，吴军进攻受阻。孙权命偏将军董袭、司马凌统各率百人敢死队，身穿重铠，乘大船冲抵蒙冲舰旁，董袭挥刀砍断棕绳，战舰顺水飘流，孙权军遂溯流而进。黄祖见孙权兵来，黄祖急派水军都督陈就率兵反击，吕蒙统率前锋部队，身先战阵，亲自斩杀陈就。孙军乘胜水陆并进，包围夏口城。孙权督军猛攻，克其城，并屠之。
黄祖只身逃窜，被骑士冯则追斩。此战，孙权大获全胜，一举歼灭宿敌黄祖，占领江夏地区。战后论功，孙权认为：“这次战事的成功，起因于先击败了陈就。”任命吕蒙为横野中郎将，并赐钱千万。
建安十三年（公元208年）十月，吕蒙还跟随周瑜、程普等人在赤壁大破曹操，曹操引军北归，留曹仁等驻守江陵。孙权命周瑜、程普统兵数万，与曹仁隔江相持。时益州将领袭肃率军投诚，周瑜上表，请孙权把袭肃所部拨给吕蒙管辖。吕蒙却有不同的见解。他从全局考虑，认为周瑜的意见欠妥。他极力称扬袭肃有胆识，有才能，并说袭肃向慕教化远道前来投诚，只该增加他的兵力，而不该褫夺他的兵权。孙权觉得吕蒙说得有理，便依照他的意思，归还了袭肃的部队。
不久，周瑜欲夺取江陵，先派甘宁袭取上游的夷陵城，对江陵形成侧背威胁。于是，曹仁分兵围攻甘宁，欲夺回夷陵。甘宁向周瑜求援，诸将担心兵少，如救援夷陵，则造成江陵空虚。吕蒙对周瑜、程普说道：“将军，留下凌公绩，我与您一道，前去救急解围，按情势不会要太多的时间，我保证凌公绩能固守十天。”接着又献策，劝周瑜派三百人用木柴把本来险峻的山路截断，当敌人逃跑时，我方就可获得他们的马匹。
周瑜采纳了他的建议，亲率主力驰援夷陵，大破曹军于夷陵城下，所杀过半。曹军乘夜逃走，途经木柴堵塞的险路，无奈，骑马者皆弃马徒行。周瑜、吕蒙驱兵追赶截击，获得战马三百匹，军威大振。随即回师渡江，进军北岸，构筑营垒，向江陵发起进攻。此时，孙权为策应周瑜攻势，派兵包围合肥。曹仁由于孤军无援，在近一年的交战中屡战失利，损失甚重，遂被迫放弃江陵城，退往荆州。周瑜占领江陵，被孙权任命为南郡太守，控制了长江中游地带。吕蒙因功被任命为偏将军，兼任寻阳令。
一次，孙权对吕蒙说道：“子明，如今身居要职掌握重权，不可以不学习。”吕蒙推脱军务繁多，没有时间。
孙权说道：“孤难道是想要你研究儒家经典而成为学识渊博的学者吗！只要粗略地阅读，了解以往的事罢了。你说你事务繁忙，谁比得上我处理的事务多呢？我常常读书，自己感到有很大的收益。”吕蒙乃悟，开始学习，日积月累，他读的书，超过了宿儒耆旧。
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